Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms