Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Tlr5Q9JLF7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Tlr5Q9JLF7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Tlr5Q9JLF7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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