Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms