Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrac1Q9JKP8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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