Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nova1Q9JKN6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nova1Q9JKN6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms