Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem1Q9JKE2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem1Q9JKE2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms