Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp5Q9JKD3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms