Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap3m1Q9JKC8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms