Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pard6bQ9JK83 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms