Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Cnga3Q9JJZ8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cnga3Q9JJZ8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cnga3Q9JJZ8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cnga3Q9JJZ8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cnga3Q9JJZ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Cnga3Q9JJZ8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms