Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bgrlQ9JJU8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bgrlQ9JJU8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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