Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc6l2Q9JIM3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc6l2Q9JIM3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms