Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Praf2Q9JIG8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms