Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms