Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClpxQ9JHS4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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ClpxQ9JHS4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms