Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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RabggtaQ9JHK4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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RabggtaQ9JHK4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtaQ9JHK4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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