Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Tmod3Q9JHJ0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod3Q9JHJ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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