Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms