Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hapln2Q9ESM3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hapln2Q9ESM3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms