Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc28a3Q9ERH8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms