Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfip11Q9ERA6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms