Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Barx1Q9ER42 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Barx1Q9ER42 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Barx1Q9ER42 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Barx1Q9ER42 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms