Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cyp3a44Q9EQW4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyp3a44Q9EQW4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms