Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQT6

Syt13, Synaptotagmin-13, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt13Q9EQT6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Syt13Q9EQT6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Syt13Q9EQT6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Syt13Q9EQT6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Syt13Q9EQT6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Syt13Q9EQT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Syt13Q9EQT6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Syt13Q9EQT6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Syt13Q9EQT6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Syt13Q9EQT6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Syt13Q9EQT6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syt13Q9EQT6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms