Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r171Q9EPS6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r171Q9EPS6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r171Q9EPS6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r171Q9EPS6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r171Q9EPS6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r171Q9EPS6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r171Q9EPS6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r171Q9EPS6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r171Q9EPS6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r171Q9EPS6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r171Q9EPS6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms