Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ap3s1Q9DCR2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ap3s1Q9DCR2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms