Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop7Q9DCH2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms