Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trmt112Q9DCG9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms