Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tomm20Q9DCC8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tomm20Q9DCC8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms