Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hmg20aQ9DC33 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmg20aQ9DC33 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Hmg20aQ9DC33 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Hmg20aQ9DC33 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hmg20aQ9DC33 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Hmg20aQ9DC33 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmg20aQ9DC33 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms