Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde1Q9DBZ9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms