Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms