Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms