Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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TrmuQ9DAT5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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TrmuQ9DAT5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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TrmuQ9DAT5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms