Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Asf1bQ9DAP7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms