Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhc1Q9D9T8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc1Q9D9T8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms