Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp12Q9D9M2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp12Q9D9M2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms