Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms