Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnot8Q9D8X5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms