Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem41aQ9D8U2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem41aQ9D8U2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms