Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tvp23bQ9D8T4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms