Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms