Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl4Q9D8E6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms