Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn9Q9D805 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms