Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem54Q9D7S1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms