Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capns2Q9D7J7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capns2Q9D7J7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms