Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn23Q9D7D7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn23Q9D7D7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms