Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf13Q9D777 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms