Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Borcs8Q9D6Y4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Borcs8Q9D6Y4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Borcs8Q9D6Y4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Borcs8Q9D6Y4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Borcs8Q9D6Y4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Borcs8Q9D6Y4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms