Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sec23bQ9D662 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23bQ9D662 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms